Пересадку костного мозга рекомендуется использовать при всех видах острых лейкемий. Огромное значение для возможности выполнения трансплантации и её успех, в первую очередь, имеет индивидуальное определение риска (высокий или низкий). Больше шансов на выздоровление после трансплантации имеют молодые люди, без нагрузки в виде хронических заболеваний (например, диабет, гипертония и т.д.).
Следует помнить и о том, что пересадка дает возможность применения химиотерапии в очень высоких дозах, которые разрушают лейкемические клетки, но, к сожалению, необратимо повреждают также правильные клетки костного мозга. Без пересадки стволовых клеток костного мозга от донора, человек после такого лечения не будет иметь шансов на выживание, из-за отсутствия производства необходимых элементов крови.
Недавно также обнаружили, что сама трансплантации имеет противоопухолевый эффект, заключенные в трансплантируемом материале (кроме стволовых клеток) T-лимфоциты донора уничтожают больные клетки, которые могут, несмотря на химиотерапию, выжить в организме реципиента.